Defnyddir Guanidine Thiocyanate fel biofeddygaeth, adweithyddion cemegol, ac ati. Gellir ei ddefnyddio fel asiant chaotropig a dadnatureiddiwr i ddadnatureiddio a hollti celloedd, echdynnu RNA a DNA, ac fel arsugniad o DSSC i wella cyfradd trosi DSSC.